学校聚焦区域经济社会发展和技术创新需求，科技创新成效显著。2013年获国家技术发明奖二等奖一项，是迄今为止福建省新建本科院校唯一获得的最高奖项。

2016～2020年获省（部）级以上科研奖励（含）41项，其中教育部自然科学奖二等奖一项、福建省科技进步奖一等奖七项、福建省技术发明奖一等奖一项、教育部第七届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）三等奖两项、全国优秀古籍图书奖二等奖一项。

2016～2020年承担国家级、省部级等各级各类科研项目2032项，其中：国家自然科学基金和人文社科基金项目立项78项，国家科技重点研发计划子课题立项5项。获授权专利959项，其中发明专利授权367项。在国内外学术期刊上发表论文3178篇，其中高水平学术论文1801篇。

目前拥有47个省级科研创新平台，其中省级重点实验室4个、省级社科基地1个、省级重点智库（培育）1个、省级协同创新中心2个、省级工程（技术）研究中心3个、省行业技术开发基地3个、“数字福建”科研创新平台2个、省高校重点实验室4个、省高校工程研究中心5个、省高校人文社会科学基地4个、其他省级平台18个。（数据截至2021年8月）。